ჰეილონძიანგში მღრღნელების „პათოგენების ბანკის“ გახსნა: ძირითადი პათოგენების, მათ შორის ლასას და ჰანტავირუსების, აღმოჩენა

ბოლოდროინდელმა მეტაგენომიკურმა კვლევამ გამოავლინა ვირუსებისა და ბაქტერიების საოცრად მრავალფეროვანი სპექტრი, რომლებსაც ჰეილონძიანგის პროვინციაში მღრღნელები ატარებენ, მათ შორის ლასას ვირუსი, ამურის ვირუსი, სალმონელა და Yersinia pestis.

კვლევაში გამოყენებული იყოპათოგენის რნმ-ის გამდიდრების ნაკრები Macro & Micro-Test-ისგან, ზონდის დაჭერის ტექნოლოგიაზე დაფუძნებული. მასპინძლის rRNA-ს და სხვა კონსერვირებული მასპინძლის ფრაგმენტების შერჩევითი შემცირების გზით, მეთოდმა ეფექტურად შეინარჩუნა მიკრობული RNA, რამაც მნიშვნელოვნად გააუმჯობესა პათოგენის აღმოჩენის მგრძნობელობა. პათოგენის RNA-ს გამდიდრების ეს ეტაპი კრიტიკულად მნიშვნელოვანი იყო მაღალი გამოვლენის მაჩვენებლის მისაღწევად და უზრუნველყოფდა პათოგენის მეთვალყურეობის ძლიერ ტექნიკურ მხარდაჭერას.

მღრღნელები: ზოონოზური დაავადებების ძირითადი რეზერვუარები

მღრღნელები ძუძუმწოვრების ყველაზე სახეობრივი და ფართოდ გავრცელებული ჯგუფია, რომელიც მსოფლიოში 2000-ზე მეტ სახეობას მოიცავს და ყველა ძუძუმწოვრის სახეობის 40%-ზე მეტს შეადგენს.

მათი ეკოლოგიური მნიშვნელობის გარდა, მღრღნელები მრავალი ზოონოზური პათოგენის მთავარ რეზერვუარებსა და გადამტანებს წარმოადგენენ.რადგან მღრღნელების ჰაბიტატები ხშირად ემთხვევა ადამიანის გარემოს — პირდაპირი ნაკბენების, ექსკრემენტებთან კონტაქტის ან რწყილებისა და ტკიპების მეშვეობით არაპირდაპირი გადაცემის გზით — მათში არსებული პათოგენები საზოგადოებრივი ჯანმრთელობის მუდმივ საფრთხეს წარმოადგენს.

აღსანიშნავია, რომ ახალი ინფექციური დაავადებების 70%-ზე მეტი ველური ბუნებიდან მოდის, ხოლო მღრღნელები ვირუსების ერთ-ერთ ყველაზე მნიშვნელოვან რეზერვუარს წარმოადგენენ.

ჰეილონძიანგის სასაზღვრო რეგიონი: პათოგენების მეთვალყურეობის წინა ხაზი

ჰეილონძიანგის პროვინცია, რომელიც ჩინეთის ჩრდილო-აღმოსავლეთით მდებარეობს, უხვი ეკოლოგიური რესურსებით გამოირჩევა და მრავალ ქვეყანას ესაზღვრება. მდიდარი ბიომრავალფეროვნებისა და საზღვრისპირა მოსახლეობის ხშირი გადაადგილების კომბინაცია პათოგენების გადაცემისთვის ხელსაყრელ პირობებს ქმნის.

2021 წლის ივნისიდან ივლისამდე პერიოდში მკვლევარებმა მუდანძიანგის ქალაქის ჰენგდაოჰეზის რაიონიდან 67 ველური მღრღნელი შეაგროვეს. ნიმუშებში შედიოდა:

ლ 20აპოდემუსის ნახევარკუნძული

ლ 47მიოდეს რუფოკანუსი

ყველა ნიმუში დაჭერილია საცხოვრებელ ტერიტორიებსა და მიმდებარე სასოფლო-სამეურნეო მიწებზე, რაც ხაზს უსვამს ადამიანის დასახლებებსა და ველური ბუნების ჰაბიტატებს შორის მჭიდრო ურთიერთქმედებას.

პათოგენის გამდიდრების ტექნოლოგია: მასპინძლის ფონური ჩარევის დაძლევა

მეტაგენომიურ სეკვენირებაში, მასპინძელი რნმ, როგორც წესი, დომინირებს სეკვენირების წაკითხვებში, რაც ნიღბავს დაბალი სიმრავლის პათოგენის სიგნალებს.

ამ გამოწვევის გადასაჭრელად, კვლევაში გამოყენებული იყოMacro & Micro-Test-ის პათოგენის მეტაგენომიკური დეტექციის ნაკრები. ზონდის დაჭერის ტექნოლოგიის გამოყენებით, სპეციალურად შექმნილი ზონდები უკავშირდება მასპინძელი rRNA-ს და კონსერვირებულ თანმიმდევრობებს, რაც ხელს უწყობს მათ გამოფიტვას და ამით მიკრობული რნმ-ის გამდიდრებას.

ამ მიდგომამ მნიშვნელოვნად გააუმჯობესა პათოგენის აღმოჩენის მგრძნობელობა, რამაც საშუალება მისცა შემდგომი სეკვენირებისას აღედგინა პათოგენის წაკითხვის უფრო მაღალი წილი. გამდიდრების ეტაპმა მყარი საფუძველი ჩაუყარა მღრღნელების მიერ გადატანილი პათოგენის სპექტრის ზუსტად დახასიათებას.

გამდიდრების შემდეგ, რნმ-ის ნიმუშებმა გაიარეს უკუტრანსკრიფცია, ბიბლიოთეკის შექმნა და მაღალი გამტარუნარიანობის სეკვენირება. ბიოინფორმატიული ანალიზი მოიცავდა:

მასპინძლის გენომის ფილტრაცია

ტაქსონომიური კლასიფიკაცია Kraken2-ის გამოყენებით

ლ სიუხვის კორექცია ბრეკენის გამოყენებით

ამ სამუშაო პროცესმა ვირუსული და ბაქტერიული საზოგადოებების ყოვლისმომცველი პროფილი შექმნა.

კვლევის შედეგები: მრავალი ვირუსისა და ბაქტერიის თანაცირკულაცია

ვირუსული დასკვნები

აღმოჩენილი ვირუსები 21 ვირუსულ ოჯახს მიეკუთვნებოდა, მათ შორისარენავირიდებიდაჰანტავირუსები.

მეშვეობითდე ნოვოMegahit-ის გამოყენებით აწყობის შედეგად, გენერირებული იქნა 154 ვირუსული კონტიგი, რომელთაგან 110 რვა ოჯახის 19 ვირუსს ემთხვეოდა.

In აპოდემუსის ნახევარკუნძული, გამოვლინდა შემდეგი ვირუსები:

l Arenaviruses: Lassa virus, Wenzhou virus, Gairo virus

ჰანტავირუსები: ამურის ვირუსი, პუუმალა ვირუსი

In მიოდეს რუფოკანუსიაღმოჩენილი იქნა ვირთხის არტერივირუსი და ამურის ვირუსი.

ამ პათოგენებს შორისაა:

ლასას ვირუსი ვირუსული ჰემორაგიული ცხელების გამომწვევი აგენტია, რომლის ლეტალურობის მაჩვენებელი დაახლოებით 20%-ს აღწევს.

ამურის ვირუსი თირკმლის სინდრომით მიმდინარე ჰემორაგიული ცხელების (HFRS) გამომწვევი ერთ-ერთი პათოგენია. ჩინეთში ჰანტავირუსული ინფექციების ყველაზე მაღალი მაჩვენებელია მსოფლიოში.

ბაქტერიული აღმოჩენები

სულ 1,051 ბაქტერიული გვარი იყო ანოტირებული.

ყველაზე გავრცელებული გვარები იყო:

ლსალმონელა(26–31%)

ლიერსინია(11–23%)

სალმონელაწარმოადგენს საკვებით გადამდები ძირითადი პათოგენს, რომელიც პასუხისმგებელია ტიფის დაახლოებით 9 მილიონ შემთხვევაზე და ყოველწლიურად დაახლოებით 110 000 სიკვდილზე მთელ მსოფლიოში.

იერსინია პესტისი, ჭირის გამომწვევი აგენტი, სამი ისტორიული პანდემიის მიზეზი გახდა. ჰეილონძიანგის პროვინცია ჩინეთის ერთ-ერთ ბუნებრივ ჭირის კერად არის აღიარებული და ჭირის მეთვალყურეობის პრიორიტეტულ რეგიონად რჩება.

კვლევის მნიშვნელობა

სამეცნიერო წვლილი

ეს კვლევა ჰეილონძიანგის მღრღნელებში ლასას ვირუსის ფრაგმენტებისა და ვირთხის არტერიიტის ვირუსის აღმოჩენის პირველ ანგარიშს წარმოადგენს, რითაც ჩინეთის მღრღნელების მიერ გადამდები პათოგენების მონაცემთა ბაზა გააფართოვა.

ის სისტემატურად ახასიათებს ვირუსულ და ბაქტერიულ საზოგადოებებს ადგილობრივ მღრღნელების პოპულაციებში, რაც სასაზღვრო რეგიონებში ზოონოზური დაავადებების მეთვალყურეობისთვის საბაზისო მონაცემებს იძლევა.

საზოგადოებრივი ჯანმრთელობის შედეგები

დასკვნები ხაზს უსვამს უწყვეტი მეთვალყურეობისა და პათოგენების სკრინინგის საჭიროებას.A. peninsulaeდაM. rufocanus.

მონაცემები წარმოადგენს სამეცნიერო მტკიცებულებებს, რომლებიც მხარს უჭერს წყაროს კონტროლის სტრატეგიებს ისეთი დაავადებებისთვის, როგორიცაა ჭირი და თირკმლის სინდრომით დაავადებული ჰემორაგიული ცხელება.

მეთოდოლოგიური ძლიერი მხარეები

მეტაგენომიკური სეკვენირება საშუალებას იძლევა როგორც ცნობილი, ასევე ახალი პათოგენების მიუკერძოებლად აღმოჩენის.

ამ კვლევაში, Macro & Micro-Test-ის პათოგენების გამდიდრების ტექნოლოგიამ აჩვენა ძლიერი ეფექტურობა, რამაც ეფექტურად გააუმჯობესა სამიზნე პათოგენების აღმოჩენა რთულ ბიოლოგიურ ნიმუშებში. შედეგები ადასტურებს მის შესაძლებლობას, ხელი შეუწყოს მაღალი მგრძნობელობის პათოგენების იდენტიფიცირებას ველური ბუნების მეთვალყურეობის დროს.

პროდუქტის რეკომენდაცია

ამ კვლევაში წარმატებული გამოყენების საფუძველზე, მაკრო და მიკრო-ტესტის პათოგენის რნმ-ის გამდიდრების ნაკრები მაღალ რეკომენდაციას უწევს მეტაგენომიური მეთვალყურეობის კვლევისთვის.

მასპინძლის ნუკლეინის მჟავების ეფექტურად შემცირებისა და მიკრობული თანმიმდევრობების გამდიდრების გზით, ნაკრები მნიშვნელოვნად აუმჯობესებს აღმოჩენის მგრძნობელობას და მონაცემთა ხარისხს. ის წარმოადგენს აუცილებელ ინსტრუმენტს რთულ ნიმუშებში პათოგენების ზუსტი აღმოჩენისთვის და უზრუნველყოფს საზოგადოებრივი ჯანმრთელობის მეთვალყურეობის, ზოონოზური რისკის შეფასებისა და აფეთქებისთვის მზადყოფნის მძლავრ ტექნიკურ მხარდაჭერას.

Contact to learn more: marketing@mmtest.com